Far Cry 6 nás zavede do tropické lokality Yara, kterou se snaží její vládce a diktátor Anton Castillo posunout vpřed, aby znovu ukázala svou bývalou slávu. Posunutí nebude velmi mírumilovné a se svým synem Diegem musí nejprve zlikvidovat místní revolucionáře.
Ve hře Far Cry 6 budeme hrát za Dani Rojas, lokálního Yarana, který se přidá k odboji, aby osvobodil svůj národ. Budeme s ním bojovat proti Antonovým vojskům na největším bojišti dosud a přejdeme džungle, pláže a také Esperanzu, hlavní město Yary. Hra bude mít znovu kooperaci pro dva hráče a tedy nebudeme muset hrát sami.